Instalar a partir dos fontes sob o Windows requer múltiplos compiladores comerciais e por causa disto é preferível instalar a partir dos executáveis. Caso você possua os pré-requisitos necessários você poderá gerar as ferramentas GUI MySQL a partir do código fonte sob o Windows.
Esta é uma tradução do manual MySQL Query Browser que pode ser encontrado em dev.mysql.com. O Manual MySQL Query Browser original é em inglês e esta tradução não é obrigatoriamente tão atualizada quanto a versão original.