InnoDB 内の各インデックスレコードには、6 バイトのヘッダが含まれる。このヘッダは、連続するレコードをリンクするためと、行レベルロックで使用される。

クラスタードインデックス内のレコードには、すべてのユーザ定義カラムのフィールドが含まれる。これに加えて、トランザクション ID 用の 6 バイトのフィールドと、ロールポインタ用の 7 バイトのフィールドが 1 つずつ含まれている。

ユーザがテーブルに主キーを定義していない場合は、クラスタードインデックスの各レコードに 6 バイトのロー ID フィールドも追加される。

セカンダリインデックスの各レコードには、クラスタードインデックスキーに対して定義されたすべてのフィールドも含まれる。

レコードには、そのレコードの各フィールドへのポインタも含まれる。 レコード内のフィールド長の合計が 128 バイト未満の場合はポインタが 1 バイト、128 バイト以上の場合はポインタが 2 バイトになる。