テーブル参照では、tbl_name AS alias_name または tbl_name alias_name を使用してエイリアスを指定することができる。

mysql> SELECT t1.name, t2.salary FROM employee AS t1, info AS t2
    ->        WHERE t1.name = t2.name;

ON 条件句には、WHERE 節で使用できる形式の任意の条件を指定できる。

LEFT JOIN の ON または USING 部分に右側のテーブルにマッチするレコードがない場合、すべてのカラムを NULL に設定した 1 つのレコードが右側のテーブルとして使用される。この規則に基づいて、対応するレコードが別のテーブルに存在しないレコードをテーブル内で検索することができる。

mysql> SELECT table1.* FROM table1
    ->        LEFT JOIN table2 ON table1.id=table2.id
    ->        WHERE table2.id IS NULL;

この例では、table2 に存在しない id 値を持つすべてのレコード（table2 に対応するレコードがないすべてのレコード）が table1 で検索される。当然、この場合、table2.id が NOT NULL として宣言されていることが前提となる。 See 項5.2.7. 「MySQL による LEFT JOIN と RIGHT JOIN の最適化」。

USING (column_list) 節に指定するカラムリスト内のカラムは、両方のテーブルに存在しなければならない。次の 2 つの節は同じことを意味する。

a LEFT JOIN b USING (c1,c2,c3)
a LEFT JOIN b ON a.c1=b.c1 AND a.c2=b.c2 AND a.c3=b.c3

2 つのテーブルの NATURAL [LEFT] JOIN の定義は、両方のテーブルに存在するすべてのカラムを指定した USING 節を持つ INNER JOIN または LEFT JOIN と同じ意味になる。

INNER JOIN と ,（カンマ）は、結合条件が指定されていない場合、同じ意味になり、どちらについても、指定されたテーブル間でデカルト積が生成される（つまり、最初のテーブルの各レコードが 2 番目のテーブルのすべてのレコードに結合される）。

RIGHT JOIN は LEFT JOIN の類似機能。コードをデータベース間で移植可能にするには、RIGHT JOIN ではなく LEFT JOIN を使用するようにする。

STRAIGHT_JOIN は JOIN と同様のものだが、異なる点として、STRAIGHT_JOIN では常に右側のテーブルの前に左側のテーブルが読み取られる。この構文は、結合オプティマイザによってテーブルが誤った順序で並べられるといった（まれな）事態に対処するために使用できる。

MySQL バージョン 3.23.12 以降では、テーブルからのデータの取り出し時に、どのインデックスを使用すべきか MySQL に知らせるためのヒントを指定することができる。これは、EXPLAIN で MySQL が使用可能なインデックスのリストの中から誤ったインデックスを使用していることが明らかになったときに役立つ。USE INDEX (key_list) と指定することによって、使用可能なインデックスの中から特定のインデックスを使ってテーブル内のレコードを検索するよう MySQL に指示できる。もう 1 つの IGNORE INDEX (key_list) 構文は、特定のインデックスを使用しないよう MySQL に指示するときに使用する。

MySQL 4.0.9 では、FORCE INDEX も使用できる。これは USE INDEX (key_list) と同じように動作するが、異なる点として、この構文の場合、テーブルのスキャンは非常にコストがかかるといいう前提に立つ。つまり、テーブルのスキャンが実行されるのは、どのインデックスを使用してもテーブル内のレコードを検索できない場合に限られる。

USE/IGNORE KEY は USE/IGNORE INDEX のシノニム。