-a または --analyze

キーの分布を分析する。このオプションを使用することにより、結合オプティマイザが、テーブルの結合順序や使用すべきキーをより的確に判断できるようになるため、結合パフォーマンスが向上する。 myisamchk --describe --verbose table_name' または MySQL で SHOW KEYS を使用することにより、キーの分布を確認できる。

-d または --description

テーブルに関する情報を出力する。

-A または --set-auto-increment[=value]

指定の値以上で AUTO_INCREMENT を開始する。ここで値を指定しなければ、次の AUTO_INCREMENT 値は、オートキーに使用された最高値に 1 を加えた値になる。

-S または --sort-index

インデックスツリーブロックを降順にソートする。 検索が最適化され、キーによるテーブルスキャンが速くなる。

-R または --sort-records=#

インデックスに従ってレコードをソートする。このソートにより、データが整理され、このインデックスでの SELECT や ORDER BY の処理速度が速くなる（最初のソートは非常に遅くなる）。 テーブルのインデックス番号を調べるには SHOW INDEX を使用する。テーブルのインデックスが myisamchk が検出する順序で表示される。インデックス番号は 1 から始まる。