tis620 キャラクタセットを使用するテーブルはすべて、myisamchk -r または REPAIR TABLE で修復する必要がある。

シンボリックにリンクされたデータベースに DROP DATABASE を実行した場合、リンクと元のデータベースの両方が削除される（3.22 では、configure は readlink() システムコールの使用可能性を検出しないので、これは行われなかった）。

OPTIMIZE TABLE は、MyISAM テーブルのみに対応するようになった。 これ以外のテーブル型のテーブルを最適化するには、ALTER TABLE を使用する。 OPTIMIZE TABLE の実行中は、他のスレッドに使用されるのを防ぐためにテーブルがロックされるようになった。

MySQL クライアント mysql は、デフォルトで --no-named-commands (-g) を指定して起動されるようになった。このオプションは、--enable-named-commands (-G) を指定して無効にすることができる。場合によって、これによって非互換性の問題が発生することがある（セミコロンなしの名前付きコマンドを使用する SQL スクリプトなどの場合）。第 1 行目のロング形式のコマンドは引き続き有効である。

日付の部分を処理する日付関数（MONTH() など）は、0000-00-00 日付の場合に 0 を返すようになった（MySQL 3.22 では、これらの関数は NULL を返していた）。

ISAM テーブルに german 文字ソート順序を使用している場合は、isamchk -r を使用してそれらのテーブルを修復する必要がある。これは、このソート順序にいくつかの変更が加えられたためである。

IF() のデフォルトの戻り値の型は、最初の引数のみに依存するのではなく、両方の引数に依存するようになった。

AUTO_INCREMENT カラムを使用して負の数を格納しないようにする。負の数を格納した場合に、-1 から 0 にラップするときに問題が発生したためである。AUTO_INCREMENT カラムには 0 を格納してはならない。CHECK TABLE は、0 値に対して警告を返す。0 値はテーブルをダンプしてリストアした場合に、変化することがあるためである。MyISAM テーブルの AUTO_INCREMENT は、より低いレベルで処理されるようになり、以前よりもかなり高速になっている。さらに、MyISAM テーブルでは、テーブルからレコードを削除した場合でも、古い番号は再利用されなくなった。

CASE、DELAYED、ELSE、END、FULLTEXT、INNER、RIGHT、THEN、および WHEN は予約語になった。

FLOAT(X) は、真の浮動小数点型になり、小数部の桁数が固定された値でなくなった。

DECIMAL(length,dec) 型を使用してカラムを宣言するときに、length 引数に符号と小数点の位置が含まれなくなった。

TIME 文字列は、以下のいずれかの形式にしなければならなくなった。 [[[DAYS] [H]H:]MM:]SS[.fraction] または [[[[[H]H]H]H]MM]SS[.fraction]。

LIKE は、= 演算子の場合と同じ文字比較ルールを使用して文字列を比較するようになった。旧バージョンの動作が必要な場合は、CXXFLAGS=-DLIKE_CMP_TOUPPER フラグを指定して MySQL をコンパイルする。

REGEXP は、どちらの文字列もバイナリ文字列でない場合はケース非依存になった。

MyISAM（.MYI）テーブルをチェックまたは修復する場合は、CHECK TABLE ステートメントまたは myisamchk コマンドを使用する必要がある。ISAM（.ISM）テーブルの場合は、isamchk コマンドを使用する。

mysqldump ファイルに MySQL バージョン 3.22 とバージョン 3.23 の間の互換性を持たせたい場合は、mysqldump に --opt オプションまたは --all オプションを指定しない。

DATE_FORMAT() へのすべてのコールをチェックして、各書式文字の前に ‘%’ があることを確認する （MySQL バージョン 3.22 以降で、この構文はすでに許可されている）。

mysql_fetch_fields_direct() は関数になり（これまではマクロ）、MYSQL_FIELD の代わりに MYSQL_FIELD へのポインタを返すようになった。

mysql_num_fields() は、MYSQL* オブジェクトに対して使用できなくなった（引数として MYSQL_RES* 値をとる関数になった）。MYSQL* オブジェクトには、代わりに mysql_field_count() を使用する。

MySQL バージョン 3.22 では、SELECT DISTINCT ... の出力は、ほとんどの場合ソートされた。バージョン 3.23 では、ソートされた出力を取得するには、GROUP BY または ORDER BY を使用する必要がある。

SUM() は、一致するレコードがない場合に 0 の代わりに NULL を返すようになった。これは、SQL-99 に対応したものである。

NULL 値を持つ AND または OR は、0 の代わりに NULL を返すようになった。これは、主に、NOT NULL = NULL のように、AND/OR 式で NOT を使用するクエリに影響を及ぼす。

LPAD() および RPAD() は、結果の文字列が length 引数より長い場合に、その文字列を短くするようになった。