ストアドプロシージャは、バージョン 5.0 開発ツリーで実装されます。 See 項2.3.4. 「開発ソースツリーからのインストール」。

この試みは SQL-99 に基づくもので、Oracle PL/SQL に類似した（ただし、同じではありません）基本構文を使用します。これに加え、外部言語でフックする SQL-99 フレームワークも実装します。

ストアドプロシージャは、サーバでコンパイルし、格納することができる SQL コマンドのセットです。これが行われると、クライアントはクエリ全体の再発行を繰り返す必要がなく、ストアドプロシージャを参照することができます。その結果、クエリを一度解析するだけで済み、サーバとクライアント間で送信される情報が少なくなるので、全体的なパフォーマンスが向上します。また、サーバに関数のライブラリを作成することで、概念レベルを高めることもできます。ただし、サーバ側で行われる作業が増え、クライアント（アプリケーション）側で行われる作業が少なくなるので、ストアドプロシージャによってデータベースサーバシステムの負荷が高くなります。

トリガは、MySQL バージョン 5.1 で実装される予定です。トリガは、実質的にはストアドプロシージャの一種で、特定のイベントが発生すると呼び出されます。たとえば、トランザクションテーブルからレコードが削除されるたびにトリガされるストアドプロシージャや、すべてのトランザクションが削除されると、顧客テーブルから対応する顧客を自動的に削除するストアドプロシージャを設定することができます。