MySQL を Linux IA-64 でコンパイルするには、弊社では以下の configure コマンドを gcc 2.96 でビルドする際に使用しています。

CC=gcc \
CFLAGS="-O3 -fno-omit-frame-pointer" \
CXX=gcc \
CXXFLAGS="-O3 -fno-omit-frame-pointer -felide-constructors \
    -fno-exceptions -fno-rtti" \
    ./configure --prefix=/usr/local/mysql \
    "--with-comment=Official MySQL binary" \
    --with-extra-charsets=complex

IA-64 には、MySQL クライアントは共有バイナリを使用します。このことは弊社のバイナリ ディストリビューションを /usr/local/mysql と異なるロケーションにインストールするには、libmysqlclient.so をインストールしたディレクトリのパスを /etc/ld.so.conf ファイルあるいは LD_LIBRARY_PATH 環境変数の値のいずれかに追加する必要があります。

項B.1.3.1. 「Problems Linking to the MySQL Client Library」 を参照してください。