MySQL インストール ウイザードは MSI の機能を使用してサーバのアップグレードを自動的に行います。これにより以前のバージョンを手動でアンインストールすることなく新しいリリースをインストールできます。インストーラーは新しいバージョンをインストールする前に自動的にシャットダウンして以前のバージョンを削除します。
自動アップグレードは同じ大きな枝番と小さな枝番を持つバージョン番号でのインストールの際にのみ利用できます。例えば、MySQL 4.1.5 から MySQL 4.1.6 に自動的にアップグレードできますが、MySQL 5.0 から MySQL 5.1 へのアップグレードはできません。